Salah satu bentuk kerjasama antara MTsN 12 Jombang dengan instansi terkait adalah dengan pihak PT. KAI. DAOP MADIUN. Bentuk kegiatan yang dilakukan adalah pembinaan dan pengarahan tentang keselamatan perkerataapian yang bertujuan untuk mengedukasi dan meminimalisasi kejadian pelemparan batu maupun kecelakaan terhadap kereta api bagi para siswa-siswi MTsN 12 Jombang. Kegiatan ini berlangsung di halaman MTsN 12 Jombang pada hari Senin 16 Januari 2023.

Acara diawali dengan pembukaan, kemudian pengarahan oleh Bapak Kepala Madrasah, Bapak Drs. H. Abdul Kharis M.MPd Selanjutnya pembinaan dan pengarahan dari Bapak Ismail selaku SPV PT.KAI.DAOP MADIUN. Pada kegiatan ini  siswa-siswi mendapatkan edukasi tentang larangan-larangan yang harus diketahui sekaligus mendapatkan pengetahun mengenai transformasi perkeretaapian yang disambut meriah  oleh siswa-siswi MTsN 12 Jombang.

Pada kesempatan tersebut PT.KAI memberikan sosialisasi tentang pelemparan batu terhadap kereta api, bahaya sabotase, bermain dijalur kereta api serta memberikan edukasi tentang tata cara naik kereta api dan memperkenalkan fasilitas pelayanan yang ada di stasiun. Sosialisai juga diselingi dengan tanya jawab dan terlihat  siswa-siswi sangat bersemangat mengikuti kegiatan hingga selesai.
Dengan adanya kegiatan ini diharapkan dapat menambah pengetahuan siswa-siswi mengenai moda transportasi kereta api juga hal-hal apa saja yang tidak boleh dilakukan ketika berada di sekitar rel dan saat ada kereta api lewat sehingga dapat menciptakan perjalanan kereta api yang aman, lancar dan terkendali. Acara berlangsung dengan antusiasme yang tinggi karena siswa-siswi yang aktif dan melakukan tanya jawab diberikan souvenir dan hadiah.